Sin embargo, la trayectoria de Quintana no se destaca por su enfoque militar sino por su carrera política y su vinculación con Evo Morales. En los primeros años del Gobierno del MAS, cuando había una oposición regional muy fuerte, Quintana tuvo un papel importante dentro del gabinete y coordinó acciones contra las figuras políticas que consideraba parte de un proyecto de desestabilización del país.

Desde el regreso del líder cocalero al país en noviembre de 2020, Quintana se ha mantenido fiel a su mentor e integra su círculo de confianza, desde donde protagonizó las últimas movilizaciones del MAS contra el Gobierno, por las que ahora el que fuera uno de los hombres más poderosos del país puede acabar en la cárcel.